Научная работа национального парка постоянно совершенствуется в направлении практических запросов основных служб парка. Основу этой работы составляют предметные исследования штатных работников парка и различных научных организаций, сотрудничающих с Национальным парком «Приэльбрусье». Научные исследования проводятся по биологическим, экологическим, гидрологическим направлениям и опасным природным явлениям.